Великофонтанська школа була заснована 20.09.1919 р., в період, коли дрібні поселення – хутори, були ліквідовані і створилося одне теперішнє село Великий Фонтан. В цей час, в період колективізації, була побудована і школа, яка стала центром села. Вона являла собою невеликий цегляний будинок, що складався з двох власних кімнат і однієї кімнати для вчителя. Ця перша школа залишилася і до цього часу та є частиною сучасної школи.

Фото будівлі першої школи

Першими вчителями школи були: Горячук Андрій Григорович – завідуючий школою, Горячук Дарія Євменівна – вчителька. Школа була початковою і містила І-ІVкласи. Початковою школою вона залишалася до 1941 р.

Під час Великої Вітчизняної війни в будинку школи фашисти влаштували конюшню. Та після звільнення села та Котовського району від німецької окупації будинок  було відремонтовано і там знову почала працювати школа, але вже як семирічна і містила І – VІІ класи. В цій школі працювали вчителі: Савенко Дмитро Онисимович – директор школи, Кобилецький Яків Іванович – вчитель математики, Савенко Євгенія Мойсеївна – вчителька початкових класів. З 1947 – 1948 н.р. починає зростати кількість учнів у школі, а також і чисельність педколективу цієї школи.

Перший післявоєнний директор -Савенко Дмитро Онисимович

У 1950 році почали добудовувати 5 класних кімнат, та у школі почав працювати талановитий вчитель-біолог Сташевський Михайло Савович. Він  разом з учнями посадив біля школи великий сад та порозроблював пришкільні ділянки.

З 1979 по 1989 р. директором школи працював Марук Іван Маркович, який продовжував добудовувати навчальні кімнати.

А саме 4 класи, спортивний зал, бібліотеку та майстерню. Після нього директором школи була призначена Чорна Зінаїда Сергіївна.

В 2009 р. розпочалася реконструкція Малофонтанської школи  і до навчального корпусу прибудували двоповерховий дитячий садок на 35 місць.Школа здобула статус навчально-виховного комплексу.

З 2011 р. директором школи  призначили Затику Геннадія Анатолійовича. 

В цьому ж році для школи виділяється для підвезення дітей з навколишніх сіл (Великий Фонтан, Миколаївка перша, Заболотники, Гидерим) шкільнийавтобус, а  вже  в 2012 – 

     2013 н.р., згідно рішення сесії районної ради, школа здобуває статус середньої школи і отримує назву Малофонтанський навчально-виховний комплекс «Загальноосвітня школа І-ІІІ ступенів – дошкільний навчальний заклад».

     В цьому ж 2013 р. в серпні місяці відбулося урочисте  відкриття при Малофонтан-ському НВК дошкільного навчального закладу.